José Cardús hatte zu den Missionen von Guarayos eine besondere Beziehung. Innerhalb seines franziskanischen Werdegangs stellten die dortigen Aufenthalte eine Art „Ruhepole“ dar. Demgegenüber standen eine lange Reihe von schlechten Erfahrungen, die Cardús in den Klöstern machte und die ihn immer wieder zwangen, den Aufenthaltsort und die Zugehörigkeit zu einem Missionskolleg zu wechseln.
Seine erste Missionserfahrung in Guarayos verlief allerdings nicht unbedingt erfolgreich. Durch seine kritischen Verbesserungsvorschläge weckte er nämlich den Unmut seiner erfahreneren Kollegen. Trotzdem gelang es ihm aber in der Folge seine Fähigkeiten und Kenntnisse für eine bessere Entwicklung der Missionen einzusetzen. Lob und Anerkennung erntete er vor allem für seine Lehrtätigkeit in den Missionen und für die erarbeiteten Lehrmaterialien. In einem Nachruf an den 1878 verstorbenen Missionspräfekten Damian Conte steht daher: „[...] y sobre todo organizó un sábio método de instruccion con notable progreso, al cual consagró el sobresaliente ingenio del jóven Misionero Padre Fray José Cardús, quien reunió ya unos 360 ninos para instruirlos.“ (Archivo Franciscano del Convento de Tarata)
Auch das von Cardús verfasste Buch „Las Misiones franciscanas entre los infieles de Bolivia“ ist Zeugnis seiner engen Verbundenheit zu den Missionen von Guarayos. Diese spiegelte sich auch in seinen Bemühungen wider, während seiner Europareise in den Jahren 1885 oder 1886 bis 1888 neues Personal für die Missionen unter den Guarayos anzuwerben. | 
