Das Reduktionsmodell kann als das durchdachteste System zur Missionierung „unberührter“ indigener Gemeinschaften gesehen werden. Die Jesuiten brachten das Modell zur vollendetsten Ausprägung, es weist aber auch innerhalb der franziskanischen Geschichte einen eigenen Entwicklungsstrang auf. Dieser Aspekt wurde bisher nur unzureichend berücksichtigt.
Bereits Anfang des 16. Jahrhunderts entwickelten die Franziskaner in Cumaná (Venezuela) Frühformen des Reduktionssystems. Ab 1538 arbeiteten sie nach diesem Modell in Paraguay, wobei zum Unterschied zu späteren Formen die Beziehung zur Kolonialmacht ausgeprägter war. Die Jesuiten, die 1568 nach Peru kamen, griffen auf die Erfahrungen der Franziskaner zurück. Sie suchten in der Folge bewusst nach einem System, das jeden „spanischen“ Einfluss ausschließen würde und eine intensive Einwirkung auf die Indígenas ermöglichte. Diese Ideen versuchten sie in Juli, am Titicacasee, umzusetzen. Diego de Torres verbreitete das dort erprobte Modell in der 1607 gegründeten Provinz von Paraguay. Die Zielsetzung der Missionierung lautete „evangelisieren durch zivilisieren und zivilisieren ohne koloniale Ausbeutung“. Die Indígenas sollten von jedem Kontakt zu den „Weißen“ ausgeschlossen werden. In sozial-wirtschaftlicher Hinsicht wurde ein gemeinschaftliches Modell geschaffen, die Annäherung an die Indígenas erfolgte über ihre eigene Stammessprache. Mit Hilfe des Theaters und der Musik wurden die Indígenas für den christlichen Glauben gewonnen.
Die Jesuiten gründeten auch in Bolivien zwei Reduktionszentren, in Mojos (heutiges Departamento Beni) und in Chiquitos (heutiges Departamento Santa Cruz) (Die Tieflandstämme). Auch diese Zentren wurden aber nach der Ausweisung der Jesuiten im Jahre 1767 aufgelassen. Im 18. Jahrhundert waren es die Franziskaner, die diese Missionierungsmethode im Tiefland erneut aufgriffen. | 
