Ein wesentlicher Teil des Werks von Konrad Theodor Preuß widmet sich der Erforschung von Mythologie, Weltbild und Religion. Seine Forschungstätigkeit konzentriert sich dabei auf zwei Regionen: Mexiko und Kolumbien. Dabei erweist er sich u.a. als ein Pionier der Dokumentation indigener Texte.
Seine extrem umfangreichen Aufzeichnungen von Mythen, Gesängen und verschiedenen Formen von Narrationen in der Originalsprache bilden bis heute wichtige wissenschaftliche und kulturelle Dokumente. Ein Teil der Texte wurde von Preuß in Zusammenarbeit mit lokalen Übersetzern durch eine paralineare, wie auch eine literarische Übersetzung an (z.B. die Mythen und religiösen Gesänge der Kagabá/Kogi in Kolumbien, vgl. Preuß 1919-1922 ).
Teile seiner Textsammlungen blieben lange unbearbeitet. Elsa Ziehm widmete sich in den 1960er Jahren den sog. „Mexicano“ Texten und weist darauf hin, dass Preuß beispielsweise durch die Verwendung dreier Zeichen, welche Betonung und Längenwerte der Vokale bezeichnen, ein Maximum an Klarheit und Korrektheit der lautlichen Darstellung erreicht hat. Darurch gelang es Ziehm, sich 55 Jahre später mit den Menschen von San Pedro in Nahua zu unterhalten (Ziehm 1968 in Müller 2003).
Konrad Theodor Preuß war als Theoretiker den Diskursen seiner Zeit verbunden, seine religionstheoretischen Arbeiten sind heute hauptsächlich von wissenschaftsgeschichtlichem Interesse. Bei seinen Feldforschungen setzte er hohe Standards in Bezug auf Genauigkeit der Dokumentation indigener Texte. Seine Textsammlungen stellen bis zur Gegenwart wertvolle wissenschaftliche Dokumente und einen Aspekt des kulturellen Erbes der betreffenden indianischen Gemeinschaften dar. | 
